Биофизика познает рак - Акоев Инал Георгиевич (серии книг читать онлайн бесплатно полностью .TXT) 📗
Сравнивали аминокислотный состав ЛДГ1 и ЛДГ5 у человека. Наиболее заметные отличия: ЛДГ1 — увеличено содержание аланина, валина, аспарагиновой кислоты, глутаминовой кислоты и метионина; ЛДГ5 — увеличено содержание аргинина, глицина, тирозина. В случае закономерных переходов от ЛДГ1 к ЛДГ5 должно уменьшаться содержание первых аминокислот и увеличиваться содержание вторых. Все они могли заменяться по принципу неправильного чтения одного из нуклеотидов кодона или по сдвигу рамки чтения (см. табл. 5).
Анализ конкретных замен в аминокислотной последовательности двух изоформ белка, связанных с изменением пролиферативной активности тканей, провели на примере сопоставления различий в аминокислотной последовательности двух изоферментов — ЛДГ1 и ЛДГ5 у цыплят и свиней.
В табл. 6 приведены только различия в аминокислотной последовательности М- и Н-форм ЛДГ у цыплят. Указаны порядковые номера аминокислот в пептидной цепи и избранные триплеты характерных для них кодонов. Из 85 различий в 70 случаях (82%) предполагаемая замена аминокислоты при переходе от Н4-формы к М4-форме могла происходить по принципу изменения одного из нуклеотидов триплета (чаще всего по первому нуклеотиду кодона — 61 случай) или по сдвигу рамки чтения (9 случаев). В 12 случаях необходима замена двух нуклеотидов триплета. Это данные в пользу возможного объяснения различий между двумя изоформами белка, характерными для разных состояний пролиферативной активности тканей, механизмами ошибочного чтения кодонов.
Однако в трех случаях — замена аланина на лизин (ГЦУ и ААА), серина на глутамин (УЦУ и ГАА) и глицинина на метионин (ГГУ и АУГ) — такое объяснение не подходит. В этих случаях единственно возможное объяснение замен связано с генетической регуляцией, с репрессией одних локусов генома и депрессией других при изменении пролиферативной активности тканей. Удивляет малый процент таких случаев (3,5%).
Таблица 6. Различия в аминокислотной последовательности М- и Н-форм ЛДГ у цыплят (выписка из работы Торфа и соавторов)
| 2 | 5 | 6 | 9 | 10 | 12 | 13 | 14 | 15 | 17 | 18 | 19 | 20 | 24 | 30 | 41 | 43 | 45 | |
| M | УЦА | ГАУ | ЦАУ | ЦАЦ | ААУ | ЦАУ | AAA | ГАГ | ГАА | ЦАЦ | ЦАЦ | ГЦУ | ЦАУ | УЦА | ГЦГ | АУГ | ГАУ | ГЦУ |
| Ser | Asp | His | His | Asn | His | Lys | Glu | Glu | His | His | Ala | His | Ser | Ala | Met | Asp | Ala | |
| H | Thr | Glu | Lys | Thr | Pro | Ala | Ala | Gly | Ser | Thr | Val | Pro | Ser | Thr | Gly | Gly | Gly | Cys |
| АЦА | ГГУ | AAA | АЦЦ | ЦЦУ | ГЦУ | ГЦУ | ГГГ | УЦУ | АЦЦ | ГУЦ | ЦЦУ | УЦА | АЦА | ГГГ | ГГУ | ГГУ | УГЦ | |
| 49 | 54 | 73 | 75 | 78 | 79 | 80 | 84 | 88 | 91 | 93 | 98 | 116 | 123 | 124 | 130 | 132 | 133 | |
| M | АЦУ | ГУУ | AAA | ЦЦЦ | АЦУ | УЦА | ГГУ | УЦА | ЦАУ | ЦУУ | АУУ | ГЦУ | АУУ | ААЦ | ГУУ | ГАУ | AAA | ЦУУ |
| Thr | Val | Lys | Pro | Phr | Ser | Gly | Ser | His | Leu | He | Ala | He | Asn | Val | Asp | Lys | Leu | |
| H | Ala | Leu | Gin | His | Val | Ala | Asp | Ala | Asn | He | Val | Val | Val | Gin | He | Asn | Val | He |
| ГЦУ | ЦУУ | ЦАА | ЦАЦ | ГУУ | ГЦА | ГАУ | ГЦА | ААУ | АУУ | ГУУ | ГУУ | ГУУ | ЦАА | АУУ | ААУ | ГУА | АУУ | |
| 135 | 147 | 150 | 153 | 167 | 172 | 175 | 183 | 190 | 192 | 199 | 212 | 213 | 215 | 217 | 222 | 224 | 226 | |
| M | АУУ | ГЦУ | АУУ | УУУ | УЦУ | ЦАУ | ГГУ | ЦУА | ГУУ | ЦАГ | ЦЦУ | ААГ | ГЦА | ЦАУ | ГАУ | ГЦА | AAA | ЦАУ |
| Не | Ala | He | Phe | Ser | His | Gly | Leu | Val | Gln | Pro | Lys | Ala | His | Asp | Ala | Lys | His | |
| H | Val | Thr | Leu | Leu | Thr | Tyr | Ala | Thr | Leu | Glu | Ala | Gln | Gln | Asp | Ala | Lys | Ser | Asn |
| ГУУ | АЦУ | ЦУУ | УУА | АЦУ | УАУ | ГЦУ | АЦУ | ЦУУ | ГАГ | ГЦУ | ЦАГ | ЦАГ | ГАУ | ГЦУ | АЛА | АГУ | ААУ | |
| 236 | 243 | 249 | 258 | 260 | 263 | 264 | 268 | 272 | 273 | 276 | 280 | 231 | 284 | 285 | 296 | 297 | 300 | |
| M | ГАУ | AAA | АГУ | ГАУ | ГЦУ | АУА | АУГ | ЦГУ | ЦЦУ | АУУ | ГЦУ | АУГ | ЦАУ | AAA | ГАУ | ГГУ | УЦА | АУУ |
| Asp | Lys | Ser | Asp | Ala | He | Met | Arg | Pro | He | Ala | Met | His | Lys | Asp | Gly | Ser | He | |
| H | Glu | Arg | Asn | Glu | Cys | Met | Leu | Tyr | Ser | Val | Leu | Thr | Tyr | Gln | Asn | Ser | Ala | Leu |
| ГАА | АГА | ААУ | ГАА | УГЦ | АУГ | ЦУГ | УАУ | УЦУ | ГУУ | ЦУГ | АЦГ | УАУ | ЦАА | ААУ | АГУ | ГЦА | ЦУУ | |
| 302 | 304 | 305 | 306 | 307 | 310 | 314 | 315 | 316 | 325 | 329 | 331 | 333 | ||||||
| M | ГАУ | ГУУ | AAA | АУГ | АУА | ЦЦУ | ГАА | ЦАГ | АУУ | ГГУ | ГАА | ЦАА | УУУ | |||||
| Asp | Val | Lys | Met | He | Pro | Glu | Gln | He | Gly | Glu | Gln | Phe | ||||||
| H | Ser | He | Asn | Gln | Lys | Asp | Ala | Lys | Leu | Ser | Asp | Lys | Leu | |||||
| АГУ | АУУ | ААУ | ЦАГ | AAA | ГАУ | ГЦА | ААГ | ЦУУ | АГУ | ГАУ | AAA | УУА | ||||||
| Примечание. Цифры в таблице — номера аминокислот по порядку, буквы — сравниваемые нами триплеты кодонов. | ||||||||||||||||||
